Hingga kini, misteri siapa otak di balik G30S masih diperdebatkan. Versi resmi Orde Baru menuding PKI. Namun, penelitian dari akademisi asing seperti Benedict Anderson dan Ruth McVey (Cornell Paper) menemukan sejumlah kejanggalan dalam versi militer. Ada juga teori lain yang menyebut campur tangan pihak asing.
Sejak masa Orde Baru, peristiwa ini selalu diperingati. Tanggal 1 Oktober ditetapkan sebagai Hari Kesaktian Pancasila, sementara Monumen Pancasila Sakti di Lubang Buaya dibangun untuk mengenang para pahlawan revolusi.
Lebih dari setengah abad telah berlalu, namun G30S/PKI tetap menjadi salah satu episode paling kontroversial dalam sejarah Indonesia. Ia meninggalkan luka, trauma, sekaligus pelajaran penting tentang bagaimana rapuhnya dinamika politik di negeri ini.